Rejestracja

Please leave these two fields as-is:
UWAGA: Prosimy o rozwiązanie prostego równania matematycznego!
zamknij

Zaloguj się

Zapomniałeś hasła?

Jeżeli nie pamiętasz swojego hasła, wyślemy Ci nowe - wystarczy skorzystać ze specjalnego formularza
Przypomnij mi hasło

Zarejestruj się
Napisano: 23 maja 2012

Liczba komentarzy: 0
Jak ugryźć technikę FISH? Wygodna przeglądarka sond

Nowa przeglądarka sond od firmy Agilent Technologies jest przyjaznym dla użytkownika i bardzo wygodnym narzędziem, które nadaje się nawet dla osób zaczynających przygodę z techniką FISH. W tym artykule, na przykładzie kilku print screenów pokazujemy możliwości tego oprogramowania.

Nowa przeglądarka sond znajdująca się na stronie Agilent Technologies jest wygodnym narzędziem bioinformatycznym. Ważną zaletą tego oprogramowania jest bezpośrednie podpięcie do bazy danych UCSC. Co więcej –  oprogramowanie SureFISH jest podpięte do specjalistycznego programu Cytogenomics służącego do analizy mikromacierzy aCGH.

Dzięki sondom SureFISH można obrazować nie tylko DNA ale i RNA: http://www.genomics.agilent.com/files/LitItems/AACR_2012_Agilent_FISH_Poster5020.pdf

Od czego zaczynamy?

1. Wejdź na stronę Agilent Technologies:

http://www.genomics.agilent.com/eFishMain.aspx.

2. Kliknij na nr chromosomu, który jest w obszarze Twojego zainteresowania.

3. Wyświetli sie obraz chromosomu i  propozycje sond, które możesz zamówić. Nie wszystkie możliwości są dostępne, jednak Agilent cały czas dodaje nowe produkty.

4. Wybierz fragment chromosomu, który jest w obszarze Twoich zainteresowań:

 

5. Podejrzyj możliwości hybrydyzacji:

 

6. Z przeglądarki sond możesz bezpośrednio wejść do przeglądarki genomowej UCSC:

 

7. Możesz również wyszukiwać sondy pasujące do konkretnych genów za pomocą okienka wyszukiwarki w prawym, górnym rogu ekranu.


Teraz możesz zamówić sondę. Nie zapomnij o sondzie centromerowej (zwykle znakowanej kolorem zielonym). Powodzenia!

image_pdfimage_print
Podziel się ze znajomymi
Skocz do formularza

Komentarze 0

Nikt jeszcze nie skomentował tego wpisu, napisz coś!
  1. Dodaj komentarz
    (wymagany)
    (wymagany)
    (wymagany)

    Pola oznaczone znaczkiem W są obowiązkowe. Musisz wypełnić wszystkie pola wymagane, aby dodać komentarz.
    Twój adres email, który podasz nie zostanie opublikowany z Twoim komentarzem.

    W treści komentarza dozwolone są tagi XHTML: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>

do góry