Rejestracja

Please leave these two fields as-is:
UWAGA: Prosimy o rozwiązanie prostego równania matematycznego!
zamknij

Zaloguj się

Zapomniałeś hasła?

Jeżeli nie pamiętasz swojego hasła, wyślemy Ci nowe - wystarczy skorzystać ze specjalnego formularza
Przypomnij mi hasło

Zarejestruj się
Napisano: 25 listopada 2011

Liczba komentarzy: 0
Bioinformatycy poszukiwani — „100 over 100″

Pod koniec października pisaliśmy o konkursie „100 over 100”. Kilka dni temu odbyła się konferencja prasowa zespołu Archon Genomics X Prize organizującego konkurs, na której podano więcej szczegółów.

Obecnie trwa rekrutacja chętnych. Pobierany jest materiał od zakwalifikowanych do badań stulatków. Rozwiązywane są również problemy logistyczne, w jaki sposób udostępnić ogromne pliki zespołom je analizującym, oraz, co najważniejsze poszukiwane są same zespoły, chętne analizować zebrane dane. Zadanie nie jest poste. Każda grupa po otrzymaniu próbek ma 30 dni na wygenerowanie stu genomów, kompletnych w minimum 98% i maksymalnie jednym błędem dopasowania na milion pz, a stworzenie jednego genomu ma kosztować nie więcej niż 1000 dolarów amerykańskich.

Według organizatorów największym wyzwaniem jest stworzenie odpowiedniego oprogramowania, które w rzetelny sposób oceni nadesłane przez zespoły genomy. Zespół X Prize ma nadzieję, że w konkursie weźmie udział co najmniej osiem niezależnych zespołów używających różnych technologii. Wyniki przez nie uzyskane, posłużą do stworzenia obszernej bazy danych, wyszukania SNPów, genów długowieczności, ale również, dzięki porównaniom różnych metod dla tych samych próbek, analizy błędów istniejących już metod składania genomów.

Korporacje takie jak Life Technologies, Illumina czy Complete Genomics, które opracowały swoje własne metody próbkowania i stworzyły do nich odpowiednie oprogramowanie tworzą zespoły. Wyścig o najszybciej i najtaniej uzyskane wyniki rozpocznie się w styczniu 2013 roku. Będziemy śledzić rozwój zdarzeń.

X Prize to konkurs organizowany przez Archon Genomics

Źródło: Genomeweb

 

image_pdfimage_print
Podziel się ze znajomymi
Skocz do formularza

Komentarze 0

Nikt jeszcze nie skomentował tego wpisu, napisz coś!
  1. Dodaj komentarz
    (wymagany)
    (wymagany)
    (wymagany)

    Pola oznaczone znaczkiem W są obowiązkowe. Musisz wypełnić wszystkie pola wymagane, aby dodać komentarz.
    Twój adres email, który podasz nie zostanie opublikowany z Twoim komentarzem.

    W treści komentarza dozwolone są tagi XHTML: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>

do góry